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深圳科學(xué)家利用基因組編輯技術(shù)突破馬鈴薯繁育難題

2018-08-16 09:22來(lái)源:深圳商報(bào)

“優(yōu)薯計(jì)劃”科研團(tuán)隊(duì)(第一排左四為黃三文,左三為張春芝)。

在美食界,馬鈴薯是一種“百變”的存在,從薯片、薯?xiàng)l、薯泥,在煎炒燜燉炸之中游刃有余地展示自己的風(fēng)味。在農(nóng)作物界,馬鈴薯是一種“神奇”的存在,它是唯一躋身四大糧食作物(小麥、稻谷、玉米和馬鈴薯)的跨界蔬菜;也是最“桀驁不馴”的農(nóng)作物之一,人類(lèi)栽培、食用了7000余年,仍無(wú)法馴化它。

不過(guò),未來(lái)馬鈴薯的種植方式可能發(fā)生翻天覆地的變化,將從種“薯塊”到播“種子”。

8月13日,在《自然》(《Nature》)子刊《自然·植物》(《Nature Plants》)雜志上在線發(fā)表了由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組所黃三文研究團(tuán)隊(duì)利用基因組編輯技術(shù)克服馬鈴薯自交不親和的研究成果,這是“優(yōu)薯計(jì)劃”2017年立項(xiàng)實(shí)施以來(lái)發(fā)表的首篇重要研究論文。

昨日,記者采訪了這篇論文的共同通訊作者——深圳農(nóng)業(yè)基因組所所長(zhǎng)、研究院黃三文和張春芝博士,深圳已成為“優(yōu)薯計(jì)劃”的基礎(chǔ)研究支撐,未來(lái)中國(guó)科學(xué)家還將在馬鈴薯繁育、馴化上走得更遠(yuǎn)。

中國(guó)科學(xué)家牽頭描繪馬鈴薯基因圖譜

馬鈴薯的食用方式雖然多種多樣,可種植方式卻一如最初。依靠塊莖種植的馬鈴薯是四倍體,也就是成體細(xì)胞中含有的染色體是最小染色體組數(shù)的四倍。四倍體遺傳非常復(fù)雜,導(dǎo)致馬鈴薯育種周期長(zhǎng),很多100多年前培育出的品種仍然在廣泛種植。另外,種植一畝馬鈴薯需要100到200公斤的薯塊,造成馬鈴薯具有儲(chǔ)運(yùn)成本高、易攜帶病蟲(chóng)害等缺陷。

如何突破?馬鈴薯聚集了世界科學(xué)界的目光。2005年,中國(guó)參與的第一個(gè)蔬菜基因組國(guó)際計(jì)劃就是由荷蘭瓦赫寧根大學(xué)發(fā)起的國(guó)際馬鈴薯基因組計(jì)劃,黃三文正是中方首席科學(xué)家負(fù)責(zé)項(xiàng)目的組織和執(zhí)行。

同時(shí),黃三文還肩負(fù)著黃瓜等國(guó)際基因組計(jì)劃。2007年,國(guó)際黃瓜基因組計(jì)劃取得重大突破,其研究成果在2009年11月的《自然·遺傳學(xué)》(《Nature Genetics》)上作為封面文章發(fā)表,這是第一個(gè)蔬菜作物全基因組分析論文,也是中國(guó)園藝界第一次在高影響因子的國(guó)際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表論文。

另一邊廂,截至2008年上半年,馬鈴薯基因組計(jì)劃仍然進(jìn)展緩慢。黃三文另辟蹊徑,采用單倍體材料、全基因組鳥(niǎo)槍法策略和新一代DNA測(cè)序技術(shù),在2009年初完成了單倍體馬鈴薯全基因組序列圖的繪制,并初步闡明了馬鈴薯自交衰退的基因組學(xué)機(jī)理并發(fā)現(xiàn)一批與馬鈴薯塊莖發(fā)育相關(guān)的基因。在2009年3月愛(ài)爾蘭會(huì)議上,世界各國(guó)科學(xué)家決定把所有資源集中在中國(guó)組織的單倍體馬鈴薯測(cè)序計(jì)劃上來(lái)。2011年7月,《自然》以封面論文發(fā)表了馬鈴薯基因組分析的成果,還被兩院院士評(píng)為2011年度“世界十大科技進(jìn)展新聞”。

馴化馬鈴薯的第一步從“自交”開(kāi)始

科學(xué)家并不滿足于此,更重要的還要突破馬鈴薯育種和繁殖方式。在國(guó)家農(nóng)業(yè)農(nóng)村部的支持下,黃三文聯(lián)合國(guó)內(nèi)外優(yōu)勢(shì)單位發(fā)起了“優(yōu)薯計(jì)劃”,用二倍體替代四倍體,并用雜交種子替代薯塊,用基因組學(xué)和合成生物學(xué)指導(dǎo)馬鈴薯產(chǎn)業(yè)的“綠色革命”。2017年,“優(yōu)薯計(jì)劃”正式啟動(dòng),并由深圳基因組所和云南師范大學(xué)共同承擔(dān),深圳主要負(fù)責(zé)基礎(chǔ)研究,云南負(fù)責(zé)育種。

“馬鈴薯跟番茄其實(shí)是同科同屬。”張春芝告訴記者,這兩種植物都是茄科茄屬的“姐妹”,基因相似度超過(guò)90%。“野生番茄自交也是沒(méi)有種子的,現(xiàn)在切開(kāi)番茄肉眼可見(jiàn)一粒粒種子都是人工馴化的結(jié)果。”張春芝表示,現(xiàn)在人們可以通過(guò)雜交獲得馬鈴薯的種子,但這樣所得到的種子培育出來(lái)的馬鈴薯只能用薯塊進(jìn)行繁殖,如果用種子繁殖的話,后代分離會(huì)非常大,商品性差。如果想獲得生長(zhǎng)一致的種子,第一步就是要培育出優(yōu)良的自交系,然后通過(guò)自交系之間相互雜交培育出新品種。

可這第一步“自交”,對(duì)于馬鈴薯來(lái)說(shuō)就是一道此前無(wú)法逾越的障礙。張春芝說(shuō),二倍體馬鈴薯普遍存在自交不親和的現(xiàn)象,自己的花粉授到自己的柱頭上,無(wú)法產(chǎn)生種子。此前已有外國(guó)科學(xué)家利用來(lái)自野生馬鈴薯中的自交不親和抑制基因Sli突破這一障礙,但卻帶來(lái)匍匐莖過(guò)長(zhǎng)、龍葵素(馬鈴薯中含有的一種有毒生物堿)含量過(guò)高等問(wèn)題。

而黃三文團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新利用基因組編輯技術(shù)解決了這些問(wèn)題。研究結(jié)果顯示,馬鈴薯的自交不親和是由核糖核酸酶基因S-RNase控制的。研究人員通過(guò)拼接獲得了該基因的全長(zhǎng)序列,并利用基因組編輯技術(shù)對(duì)此基因進(jìn)行了定點(diǎn)突變,獲得了自交親和的二倍體馬鈴薯,并通過(guò)自交獲得了不含有任何外源片段但是自交親和的馬鈴薯新材料,可以直接應(yīng)用于育種。

據(jù)了解,這是“優(yōu)薯計(jì)劃”發(fā)布的首個(gè)科研成果,“當(dāng)馬鈴薯完全利用種子種植時(shí),只需要2克的種子就能種出一畝馬鈴薯。”張春芝表示,“優(yōu)薯計(jì)劃”將會(huì)徹底顛覆馬鈴薯的生產(chǎn)方式,接下來(lái)還將發(fā)布多個(gè)科研成果。

深圳商報(bào)記者 張妍

通訊員 孟麗君

[責(zé)任編輯:常軍平]

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